| Squadron | Type | Base |
|---|---|---|
| Academia de Forca Aerea | ||
| Esquadra de Motorplanadores 802 | Chipmunk, Let L-23 Super Blanik, ASK-21 | BA1 Sintra |
| Esquadra de Instrucao Elementar de Pilotagen 101 | TB-30 Epsilon | BA1 Sintra |
| CFMTFA | ||
| various | Ota | |
| Grupo Operacional 41 | ||
| Esquadra 502 (det.) | Casa C-295M | BA4 Lajes |
| Esquadra 751 (det.) | AW101 | BA4 Lajes |
| Grupo Operacional 51 | ||
| Esquadra de Caca 201 | F-16AM/BM | BA5 Monte Real |
| Esquadra de Ataque 301 | F-16AM/BM | BA5 Monte Real |
| Grupo Operacional 61 | ||
| Esquadra de Transporte 501 | C-130H/H-30 | BA6 Montijo |
| Esquadra de Transporte 502 | C-295M/MPA | BA6 Montijo |
| Esquadra de Transporte 504 | Falcon 20C/50 | BA6 Montijo/Lisbon IAP |
| Esquadra de Busca y Salvamento 751 | AW101 | BA6 Montijo |
| Grupo Operacional 111 | ||
| Esquadra de Instrucao Complementar de Pilotagen de Avioes de Caca 103 | Alpha Jet A | BA11 Beja |
| Esquadra de Transporte 552 | SA 316 Alouette III | BA11 Beja |
| Esquadra de Reconhecimento Maritimo 601 | P-3P Orion | BA11 Beja |
| Grupo Operacional 113 | ||
| Esquadra de Transporte 552 (det.) | SA 316 Alouette III | BA13 Ovar |
CFMTFA = Centro de Formacao Militar e Tecnica da Forca Aerea (Air Force Technical School)
.